内視鏡の強みは消化管内を鮮明に映し出すことができる点です。それは時に肉眼で確認するよりも診断に役立つことがあります。非常に有意義な検査方法なのですが、動物医療においては全身麻酔を必須とする問題があります。
かつてに比べれば非常に安全に内視鏡を行うことができますが、実施の際には全身状態の把握など注意が必要になります。
対象となる疾患は消化管系腫瘍（胃がん、大腸がんなど）、胃拡張捻転症候群、腸リンパ管拡張症などです。特に動物病院では誤飲の対策に内視鏡を使用することが多くあります。誤飲の場合はまずは催吐処置を迅速に行うことが望ましいですが、吐かせることが難しい場合は胃カメラで摘出することもできます。内視鏡での摘出は目に見えて成果が出ますので、拍手が起こるようなこともあります。